1992年7月，吴江市经济技术开发区成立，总体规划面积12.33平方千米，区域范围为东起京杭大运河，西至苏州河，南起中环路（现江兴路），北至瓜泾港。首期开发面积8平方千米，起步区面积4平方千米（其中建成区面积1平方千米）。规划工业用地6平方千米，三产用地0.5平方千米，配套设施用地1.5平方千米，发展主要产业为通信设备、计算机设备及其他电子设备。

1998年8月，省政府批复同意吴江经济开发区区域范围进行调整。调整后，吴江经济开发区总面积8平方千米不变，在原址上减少2平方千米，保留6平方千米。调整后四周界址为东至京杭大运河，西至红光村水域，南至江兴路，北至夹浦桥。在京杭大运河东划入2平方千米作为吴江经济开发区建设用地，形成运东新区。划入区域为东至摇来圩小港，西至京杭大运河，南至江兴东路，北至夹浦桥。

2000年3月，为保证外资企业用地，再次调整吴江经济开发区区域范围。在原运西分区6平方千米中，划出江陵北路以南大部分、西面吴新村鱼塘部分、垃圾填埋场部分及220伏高压走廊部分共2.918平方千米。向北新辟北分区，具体四至为东起十苏王公路、南至瓜泾港、西起姚家庄村、北至清树湾村，面积2.918平方千米。

2002年6月，原属松陵镇管辖的花港、柳胥、吴新、三里桥、淞南、庞北、姚家庄、庞山、庞南、庞东、庞杨、白龙桥、凌益、龙津、西联、渔业等16个村及庞山湖农场划归吴江经济开发区管理。12月，原属同里镇管辖的厍浜、仪塔、栅桥、同兴、叶明、方尖港、叶泽等7个村划归吴江经济开发区管理。是年，吴江经济开发区管理面积80平方千米。

2008年12月，原属松陵镇管辖的清树湾村划归吴江经济开发区管理。

2013年10月31日，吴江经济技术开发区规划控制面积83平方千米，辖23个行政村，2个社区居委会，4个社区工作站；总人口30多万人，其中户籍人口9.7万人，外来人口20多万人。2013年11月1日，吴江经济技术开发区与同里镇实行“区镇合一”的管理体制，规划控制面积176平方千米。